Il clan Nubatama è uno dei due clan Shinobi dell'Impero Draconico. Questo clan è composto da draghi ninja e bestie furtive che si occupano di ottenere informazioni dai propri nemici tramite lo spionaggio e l'inganno. Sono anche combattenti molto esperti che lottano usando arti marziali e magia dell'ombra.
Un deck Nubatama è in grado di mettere in difficoltà l'avversario facendogli scartare carte dalla mano, rimuovendone momentaneamente altre, e potenziandosi in base a quante carte sono difese sono state distrutte.